北京更换食品生产经营许可证的流程如下：

1. 申请：申请人向食品药品监督管理部门提出申请，并提交以下申请材料：营业执照复印件、食品生产经营许可证申请表、食品生产经营场所合法使用证明等。
2. 受理：食品药品监督管理部门对申请材料进行审核，并决定是否受理申请。
3. 审查：食品药品监督管理部门对申请人的食品生产经营场所进行现场核查，核实该场所是否符合食品生产经营的有关要求。
4. 审批：食品药品监督管理部门对现场核查结果进行审批，决定是否批准更换食品生产经营许可证。
5. 领取许可证：如果更换食品生产经营许可证的申请被批准，申请人需要前往食品药品监督管理部门领取新的许可证。

需要注意的是，申请更换食品生产经营许可证的申请人应当具备以下条件：

1. 符合有关食品安全法律、法规、规章和标准的要求；
2. 食品生产经营场所合法、卫生、安全；
3. 食品生产经营人员具备相应的食品安全知识和健康证明；
4. 遵守食品安全管理制度；
5. 法律、法规规定的其他条件。

如果申请人的条件不符合要求，或者现场核查发现不符合有关要求，食品药品监督管理部门将不会批准更换食品生产经营许可证。